Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sema6cQ9WTM3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sema6cQ9WTM3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms