Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Htra1Q9R118 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Htra1Q9R118 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms