Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt3Q9QZ47 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms