Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms