Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms