Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slco1c1Q9ERB5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms