Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Barx1Q9ER42 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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