Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clstn1Q9EPL2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clstn1Q9EPL2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms