Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv4Q9EPK8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv4Q9EPK8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms