Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrpraQ9DBG7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrpraQ9DBG7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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