Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Jam3Q9D8B7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms