Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp4bQ9D8B3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp4bQ9D8B3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms