Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2af1Q9D883 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U2af1Q9D883 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms