Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9D7E4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q9D7E4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms