Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata1Q9D5R4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata1Q9D5R4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms