Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms