Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upk1aQ9D132 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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