Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D131 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D131 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q9D131 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q9D131 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms