Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd8Q9CX56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms