Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lhfpl3Q9CTN8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms