Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ubqln4Q99NB8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ubqln4Q99NB8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms