Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl43Q99N89 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms