Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Med28Q920D3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med28Q920D3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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