Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms