Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Stx18Q8VDS8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms