Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms