Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc12Q8R344 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms