Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Wdr47Q8CGF6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms