Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1rbQ8CFG9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms