Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp20Q8C6M1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp20Q8C6M1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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