Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ubqln3Q8C5U9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms