Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx16Q8C080 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms