Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc44a2Q8BY89 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc44a2Q8BY89 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms