Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec22cQ8BXT9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms