Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tyw3Q8BSA9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tyw3Q8BSA9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms