Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rd3Q8BRE0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rd3Q8BRE0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms