Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ubfd1Q78JW9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubfd1Q78JW9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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