Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms