Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim45Q6PFY8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms