Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhb9Q6PB60 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bhlhb9Q6PB60 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms