Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rexo4Q6PAQ4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rexo4Q6PAQ4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms