Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttf1Q62187 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms