Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms