Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf3Q5HZG4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf3Q5HZG4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms