Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nlrc3Q5DU56 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nlrc3Q5DU56 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nlrc3Q5DU56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nlrc3Q5DU56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc3Q5DU56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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