Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fam208bQ5DTT3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms