Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syne3Q4FZC9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syne3Q4FZC9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms