Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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