Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn13Q3UW68 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn13Q3UW68 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms