Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp30Q3UN04 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms